Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms