Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms