Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms