Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H3

HDDC2, HD domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2Q7Z4H3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC2Q7Z4H3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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