Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms