Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLX4IPQ5VYV7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms