Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms