Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms