Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms