Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
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