Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms