Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms