Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms