Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
REG3AQ06141 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
REG3AQ06141 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
REG3AQ06141 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms