Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms