Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIBQ01892 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms