Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms