Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA6P60900 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms