Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP9P55211 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP9P55211 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP9P55211 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP9P55211 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms