Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms