Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF5P43026 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF5P43026 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF5P43026 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF5P43026 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF5P43026 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms