Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms