Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTX2P32243 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTX2P32243 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OTX2P32243 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
OTX2P32243 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms