Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPS1P31327 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPS1P31327 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPS1P31327 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPS1P31327 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPS1P31327 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPS1P31327 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPS1P31327 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPS1P31327 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPS1P31327 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPS1P31327 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPS1P31327 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPS1P31327 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPS1P31327 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPS1P31327 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPS1P31327 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPS1P31327 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPS1P31327 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms