Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms