Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms