Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAB5AP20339 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAB5AP20339 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAB5AP20339 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB5AP20339 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB5AP20339 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB5AP20339 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB5AP20339 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB5AP20339 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RAB5AP20339 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RAB5AP20339 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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