Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NDUFS5O43920 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms