Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ2O43526 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms