Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms