Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms