Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms