Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.264e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 SH3TC1-210ENST00000506360 5829 ntTSL 216.66■□□□□ 0.264e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 SH3TC1-207ENST00000503284 560 ntTSL 416.28■□□□□ 0.24e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.134e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 SFI1-217ENST00000466991 545 ntTSL 515.75■□□□□ 0.113e-13■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.14e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 SFI1-225ENST00000488883 567 ntTSL 315.59■□□□□ 0.093e-13■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 SH3TC1-206ENST00000502669 3484 ntTSL 1 (best)15.27■□□□□ 0.044e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 PPP1R12C-203ENST00000586197 472 ntTSL 515.1■□□□□ 0.014e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 SSH3-210ENST00000532881 2587 ntTSL 1 (best)15.08■□□□□ 04e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 PICK1-204ENST00000426258 555 ntTSL 415□□□□□ -0.014e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 TSC1-206ENST00000490179 681 ntTSL 314.94□□□□□ -0.024e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 PICK1-210ENST00000468288 569 ntTSL 414.84□□□□□ -0.034e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 TSC1-205ENST00000475903 820 ntTSL 414.59□□□□□ -0.074e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 SH3TC1-221ENST00000512100 755 ntTSL 314.49□□□□□ -0.094e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 PICK1-212ENST00000472724 555 ntTSL 514.46□□□□□ -0.094e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 PHKA2-206ENST00000473739 751 ntTSL 314.08□□□□□ -0.164e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ZNF142-207ENST00000450765 6028 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.224e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 SH3TC1-225ENST00000515682 4293 ntTSL 213.68□□□□□ -0.224e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.274e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 SSH3-206ENST00000529224 673 ntTSL 413.13□□□□□ -0.314e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 PICK1-206ENST00000435166 559 ntTSL 412.92□□□□□ -0.344e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 SSH3-208ENST00000532181 948 ntTSL 312.44□□□□□ -0.424e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 SYMPK-203ENST00000593899 558 ntTSL 412.41□□□□□ -0.424e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.434e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 PICK1-207ENST00000437453 544 ntTSL 412.25□□□□□ -0.454e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ZNF142-203ENST00000433921 5800 ntTSL 211.74□□□□□ -0.534e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 PICK1-209ENST00000466374 826 ntTSL 211.71□□□□□ -0.534e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.544e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.554e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 TRIO-206ENST00000504606 817 ntTSL 211.58□□□□□ -0.564e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 PICK1-215ENST00000494434 559 ntTSL 411.45□□□□□ -0.584e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 MAD1L1-214ENST00000459731 371 ntTSL 310.74□□□□□ -0.694e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 RRP36-201ENST00000244496 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.724e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ITGA2-203ENST00000509814 3487 ntTSL 1 (best)10.08□□□□□ -0.84e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ITGA2-206ENST00000513685 3501 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.844e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 TSC1-207ENST00000493467 2219 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.854e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ITGA2-205ENST00000510722 3530 ntTSL 1 (best)9.67□□□□□ -0.864e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ITGA2-204ENST00000509960 3674 ntTSL 1 (best)9.59□□□□□ -0.874e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 PHKA2-208ENST00000486231 317 ntTSL 59.49□□□□□ -0.894e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 TRIO-214ENST00000509967 4949 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.94e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ITGA2-202ENST00000503810 3782 ntTSL 58.94□□□□□ -0.984e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 PICK1-205ENST00000432756 582 ntTSL 58.8□□□□□ -14e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.224e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.234e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 RRP36-202ENST00000607394 528 ntTSL 25.59□□□□□ -1.514e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 GPX4-208ENST00000592940 1184 ntTSL 522.6■■□□□ 1.213e-8■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 GPX4-203ENST00000585480 501 ntTSL 215.04■□□□□ -03e-8■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 GPX4-204ENST00000587648 536 ntTSL 29.13□□□□□ -0.953e-8■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 HM13-219ENST00000487964 902 ntTSL 516.56■□□□□ 0.242e-13■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 HM13-206ENST00000460389 1075 ntTSL 513.9□□□□□ -0.182e-13■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 HM13-222ENST00000494153 757 ntTSL 513.64□□□□□ -0.232e-13■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 HM13-217ENST00000483310 755 ntTSL 312.09□□□□□ -0.472e-13■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 HM13-212ENST00000469097 801 ntTSL 511.37□□□□□ -0.592e-13■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 HM13-214ENST00000472128 865 ntTSL 510.13□□□□□ -0.792e-13■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.365e-6■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.195e-6■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.075e-6■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 DAZAP1-209ENST00000590419 508 ntTSL 314.56□□□□□ -0.085e-6■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 DAZAP1-206ENST00000587833 560 ntTSL 510.57□□□□□ -0.725e-6■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.753e-22■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ETV4-206ENST00000585508 760 ntTSL 519.31■□□□□ 0.683e-22■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.643e-22■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.423e-22■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.323e-22■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ETV4-210ENST00000590236 616 ntTSL 315.76■□□□□ 0.113e-22■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.063e-22■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.083e-22■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 ETV4-209ENST00000587151 582 ntTSL 514.23□□□□□ -0.133e-22■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.015e-6■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 NISCH-213ENST00000489895 5350 ntTSL 217.57■□□□□ 0.45e-6■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 NISCH-205ENST00000467594 1014 ntTSL 215.47■□□□□ 0.075e-6■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.185e-6■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.118e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.158e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.218e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.38e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.318e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.568e-7■■■□□ 15.9
RBM22Q9NW64 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.343e-6■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-6■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 GRB7-213ENST00000584819 1146 ntTSL 214.77□□□□□ -0.053e-6■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 GRB7-211ENST00000583813 560 ntTSL 414.62□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 GRB7-210ENST00000578702 630 ntTSL 313.84□□□□□ -0.193e-6■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.832e-10■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.632e-10■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.312e-10■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ACTG1-205ENST00000572105 1168 ntTSL 514.1□□□□□ -0.152e-10■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ACTG1-215ENST00000576917 1958 ntTSL 514.03□□□□□ -0.162e-10■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.182e-10■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-10■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ACTG1-214ENST00000576544 1720 ntTSL 512.59□□□□□ -0.392e-10■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 PLXNB1-219ENST00000497627 317 ntTSL 38.4□□□□□ -1.066e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.212e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.922e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 326.42■■□□□ 1.822e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.782e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.782e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.712e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 NOP53-207ENST00000598681 1358 ntTSL 522.58■■□□□ 1.212e-7■■■□□ 15.8
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