Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms