Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP7BPQ9NSQ0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms