Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms