Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ARFGAP3Q9NP61 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ARFGAP3Q9NP61 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms