Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNN2Q99439 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNN2Q99439 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNN2Q99439 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNN2Q99439 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNN2Q99439 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNN2Q99439 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNN2Q99439 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNN2Q99439 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CNN2Q99439 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CNN2Q99439 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CNN2Q99439 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN2Q99439 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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