Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms