Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms