Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms