Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms