Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms