Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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