Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NUP35Q8NFH5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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NUP35Q8NFH5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NUP35Q8NFH5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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