Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD1Q8N9F7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms