Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS8Q8N3P4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS8Q8N3P4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms