Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms