Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms