Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDSS1Q5T2R2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms