Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms